对萨达姆来说，监狱生活十分艰难。还没有被单独羁押时，他经常一身长袍，穿着穆斯林传统的宽松裤，脚踏一双拖鞋，在监狱大院里与其他犯人聊天。他与同在这一监狱的密友舍克利度过了大部分时间。有一次，萨达姆还组织了一个要求改善监狱条件的绝食行动。其余时间萨达姆主要用在了他最喜爱的业余爱好--读书中。一次他回忆说："在监狱的时候，我读完了欧内斯特·海明威的所有小说。我特别喜欢《老人与海》这部书。"28萨吉达每周探望他一次。一天，萨吉达回到家中，发现她已经被房东驱逐了，家里的东西全被扔在大街上。萨吉达只得搬到她父亲海拉拉家。以后每次探监时，萨吉达都会把他们的孩子乌代带上。在婴儿的衣服里，萨达姆经常会找到他的复兴党朋友们写给他的字条。这成了他与复兴党领导人保持联系的一个重要途径。在监狱期间，萨达姆被任命为新成立的"复兴党地区领袖"组织的副秘书长。

1966年发生了两个震动伊拉克政坛的事件。叙利亚爆发了政变，阿弗拉克被逐出复兴党的全国指挥部。4月，阿里夫在一次直升机坠毁事件中丧生，他的弟弟阿卜杜勒·拉曼·阿里夫继任总统一职。复兴党又一次需要萨达姆，他得到消息，是时候准备越狱了。萨达姆和舍克利制定了一个计划。7月23日，在法庭受完审讯后返回监狱的途中，萨达姆和舍克利说服狱警，在阿布努瓦斯大街上的拉贡朵拉饭店停车吃午餐。吃饭过程中，他们二人走到盥洗间，悄悄从饭店的后门溜了出去。萨达姆的一位复兴党员表弟正在一辆黄色的汽车上等他们。萨达姆认为，萨吉达和乌代居住的舅舅海拉拉家已经太危险了。因此，萨达姆在一些复兴党人的家里藏了起来；他和贝克尔一起，秘密策划进行下一个行动。

十年中的第四次政变字体 [大 中 小] 1967年夏天，中东地区的紧张局势对伊拉克国内政治产生了巨大影响。6月，伊拉克与约旦和埃及缔结了一个防务协议。当以色列和埃及、叙利亚以及约旦等阿拉伯国家爆发战争时，伊拉克派遣了大约1.2万名士兵进入约旦助战。由于伊拉克与以色列并不接壤，因此伊拉克在这场战争中扮演次要角色。不过，伊拉克部队的确与以色列军队进行了正面对抗，以色列的战机袭击了伊拉克国内的空军基地。1967年6月爆发的战争以阿拉伯国家耻辱地战败告终。以色列军队占领了埃及的西奈和加沙，叙利亚的戈兰高地，约旦河西岸以及曾经属约旦管辖的耶路撒冷部分地区。战争结束后，伊拉克拒绝签署正式的停火协议。为了对美国人在战争中给以色列提供支持表示抗议，伊拉克断绝了与美国的所有外交关系，并停止对西方供应石油。阿拉伯国家的部长们在巴格达开会，考虑对西方国家实施全面的石油禁运。

然而，战争并没有让复兴党人放弃推翻政府的计划。1968年7月17日，一群复兴党人闯进了总统府的大院。萨达姆·侯赛因也在其中，他身穿军装，站在一辆坦克上。跟着零零星星地响起了几阵枪声。哈尔丹·提克里提将军给阿里夫打了个电话，把他从睡梦中惊醒。提克里提告诉他："我被授权通知你，你不再是伊拉克总统了。复兴党已经控制了国家。如果你和平投降，我可以保证你的人身安全。"29震惊中的阿里夫走到总统府的门厅，发现提克里提正在那里等他。阿里夫同意投降，并离开伊拉克前往伦敦。

伊拉克在10年里发生的第四次政变就这样波澜不惊地发生了。当时没有关于流血事件的报道。巴格达电台播发了一则声明，声称这次革命结束了"一个无知的政府的统治，它充满了机会主义者、盗贼、间谍、帝国主义的代言人、犹太复国主义分子、嫌疑犯以及为自己牟取不正当利益的自我主义者……"30这份宣言继续指责阿里夫政权无视军队的需要，从而导致在1967年与以色列的战争中大败，并且还加深了政府与库尔德人之间的矛盾。31伦敦《卫报》报道称："这些新统治者们对前政府的腐败和无能大加谴责，肯定能在全体伊拉克人中引起共鸣……当时伊拉克人普遍有这种感觉：正是因为前政府的无能和腐败导致了阿拉伯人在6月的那场战争中颜面尽失。"32